Beňovy jsou starou vsí — první písemná zmínka pochází z roku 1227. V té době stávala na kraji vesnice gotická tvrz, sídlo místní šlechty. V průběhu staletí byla postupně upravována — nejprve v renesančním, později v barokním slohu. Dnes je z ní zřícenina, která pomalu zarůstá zelení a připomíná, že Beňovy mají za sebou mnohem delší příběh, než by jejich dnešní velikost napovídala.
Na návsi po staletí rostla památná lípa srdčitá, jejíž stáří se odhadovalo na více než 400 let. Pamatovala by tedy dobu třicetileté války, příchod Habsburků i celé generace místních obyvatel. Už tu nestojí, ale v paměti vesnice zůstává.
V průběhu 20. století byla vesnice úředně zrušena a jako část města Klatovy obnovena roku 1964.